MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacteroides salanitronis DSM 18170 plasmid pBACSA02

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015168	ATTTT	2	10	21	30	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015168	TG	3	6	133	138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015168	TA	3	6	191	196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015168	TA	3	6	229	234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015168	TAA	2	6	246	251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015168	TAA	2	6	262	267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015168	T	8	8	272	279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015168	ATA	2	6	296	301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015168	A	6	6	1075	1080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015168	GAC	2	6	1110	1115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015168	TGT	2	6	2913	2918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015168	TAT	3	9	2933	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015168	ATA	2	6	2966	2971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015168	A	6	6	3005	3010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015168	ATA	2	6	3047	3052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015168	TTCT	2	8	3063	3070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015168	TAAT	2	8	3072	3079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015168	A	6	6	3108	3113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015168	TA	3	6	3123	3128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015168	T	6	6	3158	3163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015168	GAAAAG	2	12	3207	3218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015168	TA	3	6	3287	3292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015168	TGG	2	6	4612	4617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015168	GCAA	2	8	4717	4724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015168	CGGA	2	8	4737	4744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015168	ATC	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015168	CGA	2	6	4855	4860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015168	A	6	6	4970	4975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015168	A	6	6	5574	5579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015168	GTAT	2	8	5679	5686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015168	ATA	2	6	8336	8341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015168	GCA	2	6	8399	8404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015168	TAA	3	9	8408	8416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015168	A	6	6	8415	8420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015168	TA	3	6	8421	8426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015168	AAT	2	6	8603	8608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015168	GTT	2	6	8609	8614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015168	ACAA	2	8	8634	8641	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015168	TAA	2	6	8648	8653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015168	GAA	2	6	8832	8837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015168	GA	3	6	8846	8851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015168	AAAAT	2	10	8856	8865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015168	TGT	2	6	9014	9019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015168	ATC	2	6	9278	9283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015168	GAA	2	6	9286	9291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015168	CA	3	6	9339	9344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015168	CTT	2	6	9432	9437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015168	ATG	2	6	9454	9459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015168	TCA	2	6	9562	9567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015168	GAT	2	6	9622	9627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015168	GTAT	2	8	9654	9661	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015168	C	6	6	9665	9670	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_015168	GGTCC	2	10	9678	9687	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_015168	GTCTCT	2	12	9699	9710	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015168	CTTC	2	8	9789	9796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015168	TCA	2	6	9821	9826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015168	AGC	3	9	9834	9842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015168	CTT	2	6	9943	9948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015168	TC	3	6	9958	9963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015168	TGG	2	6	10127	10132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015168	ACA	2	6	10179	10184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015168	GT	3	6	10209	10214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015168	CCG	2	6	10382	10387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_015168	AGG	2	6	10403	10408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015168	GAT	2	6	10414	10419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015168	GA	3	6	10481	10486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015168	GAGT	2	8	10530	10537	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015168	TCTTTG	2	12	10581	10592	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015168	CAA	2	6	10643	10648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015168	AAT	2	6	10672	10677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015168	GAA	2	6	10731	10736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015168	GATT	3	12	10800	10811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015168	TGA	2	6	11027	11032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015168	AAT	2	6	11034	11039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015168	GAA	2	6	11210	11215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015168	GTA	2	6	11219	11224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015168	TCT	2	6	11245	11250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015168	ATT	2	6	11259	11264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015168	T	6	6	12165	12170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015168	A	6	6	12225	12230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015168	A	6	6	13416	13421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015168	TGTC	2	8	15690	15697	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015168	CTT	2	6	17327	17332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015168	A	6	6	17371	17376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015168	ATG	2	6	17897	17902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015168	A	7	7	18064	18070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015168	TTGGA	2	10	18075	18084	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015168	TAA	2	6	18085	18090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015168	TG	3	6	18097	18102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015168	TG	4	8	18132	18139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015168	T	7	7	18147	18153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.